לצד המתיחות הביטחונית עם ישראל, ובצל משברים כלכליים ופנימיים רבים, נמשכת באיראן החמרה ביחס כלפי אזרחים ממוצא אפגני החיים במדינה. לפי דיווחים של רשת "איראן אינטרנשיונל", שבסיסה בלונדון ומזוהה עם האופוזיציה האיראנית, גוברות לאחרונה פעולות הבדיקה, ההשפלה והגירוש מצד הרשויות האיראניות כלפי אפגנים. הסיבה המרכזית שמציינות הרשויות – חשד לשיתוף פעולה עם ישראל.
על פי הדיווחים, אזרחים אפגנים באיראן מתמודדים עם מעצרים פתאומיים, חקירות ממושכות, בדיקות פולשניות של טלפונים ניידים ואף איומים בגירוש מהיר מהמדינה. חלקם מדווחים כי נעצרו בשל "כניסה לא חוקית" או עבודה ללא היתר, אולם בפועל, החשד המרכזי, גם אם לא מוצהר באופן רשמי, הוא לכאורה מעורבות בפעילות מודיעינית נגד המשטר.
במקביל, מדווחת "איראן אינטרנשיונל" כי מספר המגורשים עלה באופן חד בשבועות האחרונים, כאשר הרשויות נוקטות מדיניות של סילוק מהיר כלפי כל אדם שמעמדו אינו מוסדר. דו"ח של הארגון הבינלאומי להגירה מצביע על כ-690 אלף אפגנים שגורשו מאיראן במהלך ששת החודשים הראשונים של 2025 בלבד – כ-70% מהם באכיפה כפויה.
היסטורית, היחסים של המשטר האיראני עם מבקשי המקלט מאפגניסטן התאפיינו באמירה כפולה: מחד, פתיחת שערים בשם סולידריות דתית; מאידך, היעדר מדיניות מוסדרת, זכויות, או מעמד קבוע. לדברי מבקרי המשטר, השלטון באיראן עשה במשך השנים שימוש ציני באפגנים – הן ככוח עבודה זול, והן ככוח לוחם בשליחותו, למשל בלחימה בסוריה במסגרת "חטיבת הפאטמיון".
עם התגברות הלחץ הבינלאומי על איראן בעקבות שורת תקיפות מוצלחות שיוחסו לישראל, החלה בטהראן להתגבש נראטיב חדש – שלפיו אזרחים אפגנים מסוימים מסייעים לגורמים זרים לפגוע בביטחון הלאומי. המידע בדבר כך מועבר בעיקר דרך פרסומים בתקשורת המזוהה עם המשטר, אך ללא ביסוס פומבי או שקיפות משפטית. בעיני פעילי זכויות אדם, מדובר במסע הסתה מוסדר.
בתוך כך, מדווחת רשת "איראן אינטרנשיונל" גם על מקרים של תקיפות פיזיות, שריפת בתים, מעצרים ללא הליך משפטי הוגן, והדרת ילדים אפגנים ממערכת החינוך. בשטח ניכרת מגמת הסלמה, במסגרתה אזרחים אפגנים חשים איום ממשי על ביטחונם, גם מצד המוסדות וגם מצד חלק מהציבור.
הדאגה המרכזית בקרב גורמי סיוע בינלאומיים היא שצעדים אלו אינם רק תגובה ביטחונית, אלא חלק מאסטרטגיה פוליטית שמטרתה להסיט את תשומת הלב הציבורית מהמצב הכלכלי הקשה באיראן ולחזק את תחושת האיום הפנימי.